Родился 20 января 1866 г. в г. Спасске Казанской губернии в мещанской семье. Отец, Николай Андреевич Варгин, сын бывшего крепостного крестьянина, держал в Спасске бакалейную лавку и слыл известным в округе оптовым торговцем спиртными напитками. Владимир в 1884 г. окончил с серебряной медалью классическую гимназию в г. Екатеринбурге, в 1888 гю - курс Высшей сельскохозяйственной Петровской (ныне Тимирязевской) академии в Москве, был удостоен степени кандидата сельского хозяйства за сочинение "О зеленом удобрении". В 1889-1899 гг. заведовал фермой, был руководителем практических занятий и преподавателем основных специальных сельхозпредметов в среднем сельскохозяйственном Красноуфимском училище Пермской губернии, завучем сельхозотделения этого училища. В 1908 г. был делегатом первого Всероссийского съезда представителей кооперативных учреждений. В 1899-1913 гг. работал губернским агрономом Пермского земства, с 1913 по 1929 гг. - заведующий сетью опытных учреждений Пермской губернии, с 1920 г. агроном-консультант по опытному делу и его применению при Пермской сельскохозяйственной опытной станции. В этом же году избран профессором агрономического факультета по кафедре "Организация хозяйства" Пермского университета. Опубликованы труды В.Н. Варгина. Его книги: "Почвоведение", "Питание и размножение растений", "Удобрение", "Обработка почвы" изданы в Берлине в 1921-1922 гг. В.Н. Варгина называли "зачинателем уральской агрохимии". Ему присвоено звание Героя труда. Умер 15 марта 1936 года.